お問い合わせありがとうございます。
本来であれば崩れ始める前の状態に戻すことで元に戻るはずなのですが、改善しないということでしたので、テンプレートやプラグインのアップデートではなく、WordPressのアップデートを行ったためテーマが崩れてしまった可能性も考えられます。
その場合は、CSSやPHPの修正が絡んできますのでテーマのアップデートを気長に待つか、もしくは、業者に修正してもらうしか方法はないかもしれません。

弊社の方でもお見積もりはできますのでお気軽にご相談くださいませ。

私のワードプレスブログもデザインが崩れてしまい困っているところです。

・新たな無料テンプレートをダウンロード
・プラグイン更新を3つほどやりました
・新しいテンプレートに変更した時からデザインが崩れ始める
（リンク広告がタイトル下、記事下に配置していたはずが、ページ最下位に２つ表示されてしまう）
（パソコンだとサイドバーに２つとも表示されてしまう）

といった症状に・・・。

新しいテンプレートを削除しましたが改善せず。
プラグインを全て停止してみましたが変化なし。

何か他に原因があるのでしょうか？

初コメントでこのような相談をしてしまい申し訳ありません。。。

ついついコメントしてしまいました。